1990年，我院被江苏省卫生厅确认为新药临床试验单位。1998年与中国药科大学药代动力学中心共同申报成功Ⅰ期临床试验研究室(A类)。2001年9月SFDA批复我院为国家药品临床研究基地，2005年10月医院获得《药物临床试验机机构资格认定证书》，认定专业为心血管、消化、呼吸、内分泌、核医学等17个专业具备相应临床试验资质。2006年12月医院申报成功江苏省科技厅重大社发项目“江苏省心血管药物临床试验服务中心”（全省4个）。2008年7月临床药理实验室（Ⅰ期）获得由中国合格评定国家认可委员会（CNAS）颁发的 ISO/IEC17025标准《实验室认可证书》（药物代谢动力学检测）。2018年4月医院完成国家医疗器械临床试验机构资质备案，拥有医疗器械临床试验专业59个；2020年10月医院完成药物临床试验机构资质备案，拥有药物临床试验专业18个。自资格认证以来，医院积极参加国际、国内创新药械临床试验，承接药械临床试验千余项，其中牵头项目数十项（含多项结构性心脏病治疗性医疗器械）。近年来有20余项药物临床试验项目入组数量居全国前三名（内分泌科、核医学科等）。医院在临床试验机构管理、研究质量、开展速度、贡献度等多方面受到业界肯定。机构为创新药械、紧急救治医疗器械试验项目开辟绿色通道，尽早完成机构立项审查及伦理审查，积极助力新药械产品快速实现成果转化。